1990년대 후반 프랜차이즈 산업이 팽창하면서 정부 개입도 시작됐다. 가맹본부와 점포 사이 갈등 조정과 산업 육성이 정부 정책의 골자라 할 수 있다.

`가맹거래 공정화에 관한 법률`은 2002년 제정됐다. 편의점 가맹본부와 가맹점 사이에 분쟁이 제기되고 영세 프랜차이즈 사업자로 인한 피해 사례가 늘면서 만들어졌다.

이 법이 시행되면서 가맹본부들은 브랜드 현황과 가맹점 사업자 부담, 영업 활동 조건, 계약 해지와 갱신 조건, 본부 재무제표 등을 담은 정보공개서를 창업자에게 의무적으로 제공하게 됐다. 또 가맹본부가 정보공개서 내용을 공정거래위원회에 등록하게 해 창업 희망자가 여러 브랜드의 정보공개서 내용을 미리 열람할 수 있도록 만들었다.

2007년에는 프랜차이즈 본부와 가맹점 사이 분쟁을 조정하는 기능을 한국공정거래조정원이 전담하도록 했다.

관리ㆍ규제 못지않게 국내 프랜차이즈 육성을 위한 발걸음도 빨라지고 있다.

2009년 지식경제부는 국내 프랜차이즈 산업을 위한 `자영업자 경쟁력 강화를 위한 프랜차이즈 산업 활성화 방안`을 내놨다. 이 방안에 따르면 정부는 2012년까지 가맹점 1000개 이상 프랜차이즈 100개를 육성하고 세계 100대 프랜차이즈 기업군에 국내 브랜드를 3개 이상 진입시키는 것을 목표로 하고 있다.

소상공인진흥원도 우수 프랜차이즈를 선별ㆍ지원하기 위해 지난해부터 `프랜차이즈 수준평가제도`를 만들어 시행하고 있다. 프랜차이즈 수준평가제도는 프랜차이즈 가맹본부가 사업을 수행하기에 적합한 시스템과 경영 역량을 갖췄는지, 재무 상태는 어떤지, 본부에 대한 가맹점 사업자 반응은 어떤지 등을 다면적으로 평가하는 제도다. 수준평가를 받은 기업들은 디자인 개발, 정보화 시스템 개발 등 정부의 다양한 지원을 받을 수 있다.